Giải lần này có 60 trường đại học, cao đẳng và học viện trên toàn quốc đăng ký tham gia. Ngoại trừ đội chủ nhà của vòng chung kết (ĐH Nha Trang), 59 đội sẽ thi đấu vòng loại ở 4 khu vực để tranh 11 suất có mặt ở vòng chung kết từ ngày 9 đến 27/1/2026. Cụ thể như sau:

Bảng A ở khu vực phía Bắc với 12 đội. Các đội sẽ chia thành 3 nhóm thi đấu vòng tròn tính điểm, chọn 3 đội đứng đầu mỗi nhóm có mặt ở vòng chung kết. Các đội sẽ thi đấu từ ngày 12 đến 20/1 tại ĐH Thủy Lợi (Hà Nội).

Ở bảng B khu vực miền Trung, nhưng chỉ có 4 đội tham dự. Các đội sẽ thi đấu vòng tròn 1 lượt tính điểm, chọn đội đứng đầu vào tranh vòng chung kết. Các đội sẽ thi đấu từ ngày 18 đến 22/1 tại sân vận động Quân khu 5 (Đà Nẵng).

Bảng C khu vực TP.HCM với sự tham dự của 35 đội. Đây là khu vực có số đội tham dự đông nhất, nên các đội thi đấu sẽ chia làm 9 nhóm (4 đội/nhóm và 1 nhóm có 3 đội).

Các đội thi đấu vòng tròn một lượt tính điểm, xếp hạng để chọn 9 đội xếp nhất và 2 đội xếp nhì có thành tích tốt nhất tại 9 nhóm, cùng với đội xếp nhì khu vực Tây Nam Bộ vào thi đấu trận đấu play-off để chọn 6 suất tham dự vòng chung kết. Các đội sẽ thi đấu từ ngày 9 đến 27/1 tại ĐH Tôn Đức Thắng và sân Tao Đàn.

Bảng D khu vực Tây Nam Bộ với số lượng 8 đội góp mặt. Các đội chia hai nhóm thi đấu vòng tròn một lượt tính điểm xếp hạng. Chọn 2 đội xếp nhất thi đấu trận chung kết khu vực từ ngày 15 đến 22/1 tại sân ĐH Đồng Tháp. Đội thắng trận chung kết sẽ giành suất tham dự vòng chung kết, đội thua trận chung kết (đội xếp thứ nhì khu vực) sẽ đá play-off với 1/11 đội khu vực TP.HCM trên sân Đại học Tôn Đức Thắng vào ngày 27/1 để giành suất tham dự vòng chung kết. 

Vòng chung kết dự kiến tổ chức từ ngày 7 đến ngày 22/3 tại sân vận động của ĐH Nha Trang (Khánh Hòa). Năm nay, giải sẽ giữ nguyên cơ cấu giải thưởng như các mùa trước. Theo đó, đội vô địch sẽ nhận cúp, HCV và phần thưởng 300 triệu đồng. Đội hạng nhì sẽ nhận HCB cùng phần thưởng 150 triệu đồng. Hai đội đồng hạng ba sẽ nhận HCĐ cùng 70 triệu đồng. Đội đoạt giải phong cách sẽ nhận 40 triệu đồng. Giải do Thaco là nhà tài trợ chính.

Kết thúc vòng chung kết giải bóng đá Thanh Niên sinh viên năm 2026, báo Thanh Niên sẽ tổ chức giải bóng đá Thanh Niên sinh viên quốc tế 2026 – Cúp THACO, đây là lần thứ hai báo Thanh Niên và LĐBĐ Việt Nam tổ chức giải sinh viên quốc tế.